非小细胞肺癌明确病理类型后，要进行TNM分期。部分局限晚期3期之前可行手术治疗。 晚期非小细胞肺癌首先进行基因检测。如查EGFR、KRAS、ALK、ROS1、C―met、HER2、RET、BRAF.基因检测阳性给予针对性的分子靶向药物治疗。 
1.EGFR突变（19、21突变）：盐酸埃克替尼片、吉非替尼片、盐酸厄洛替尼片。
第二代EGFR-TKI （野生型及突变型）（18突变）：阿法替尼片。 
第三代EGFR 和T790M耐药突变:AZD9291（奥希替尼片）对野生型没有作用。 
Rociletinib(T790M突变）.Osimertinib.
AZD3759对脑实质和脑膜渗透强。
EGFR/HER2基因突变及KRAS野生型。 
卢瑟替尼。

EGFR突变后耐药的研究：扩增，旁路激活。54％为T790M,34%为T790M+拷贝（c―met）,7%出现单核苷酸变异。

2.ALK基因突变：
c―MET、ALK、ROS1:克唑替尼。的。
第一代ALK:克唑替尼片
第二代ALK:色瑞替尼片
(LDK378)
、AP26113（二个耐药靶点）、艾乐替尼（三个耐药靶点）。
第三代ALK:Alectinib，劳拉替尼(9个耐药靶点）。
ALK/ROS1耐药可选lorlalinib. 
PF-06463922.

3.EGFR、ALK之外的靶向治疗.
Ret融合基因：凡德他尼、Cabozantinib.
C-met扩增导致EGFR抑制剂耐药：克唑替尼片、Cabozantinib.
ROS1:克唑替尼片、色瑞替尼片、Alectinib、劳拉替尼片。
4.多靶点新药：索拉非尼片。
5.ERBB2:曲妥珠单抗。

6.免疫治疗：PD-1（Vivdumab）/PD-L1抗体药物。

7.贝伐珠单抗联合铂类治疗非鳞非小细胞肺癌。

8.HER1/EGFR、HER2、HER4:达克替尼片。

9.BRAF突变：达拉菲尼。

10.多靶点：卡搏替尼（对VEGFR,met,EGFR,KRSA）

11.WEGFR:阿帕替尼片。

12.PIK3CA:如GDC―0941(二期）。

13.NF1:依维莫司。